जब एक सीएनसी प्रणाली सक्रिय होती है, तो वांछित कट्स को सॉफ्टवेयर में प्रोग्राम किया जाता है और संबंधित टूल और मशीनरी को निर्देशित किया जाता है, जो एक रोबोट की तरह निर्दिष्ट आयामी कार्यों को पूरा करते हैं।

सीएनसी प्रोग्रामिंग में, संख्यात्मक प्रणाली के भीतर कोड जनरेटर अक्सर त्रुटियों की संभावना के बावजूद तंत्र को दोषरहित मान लेगा, जो तब अधिक होता है जब सीएनसी मशीन को एक साथ एक से अधिक दिशाओं में काटने के लिए निर्देशित किया जाता है।संख्यात्मक नियंत्रण प्रणाली में एक उपकरण की नियुक्ति को इनपुट की एक श्रृंखला द्वारा रेखांकित किया जाता है जिसे पार्ट प्रोग्राम के रूप में जाना जाता है।

संख्यात्मक नियंत्रण मशीन के साथ, प्रोग्राम पंच कार्ड के माध्यम से इनपुट किए जाते हैं।इसके विपरीत, सीएनसी मशीनों के प्रोग्राम छोटे कीबोर्ड के माध्यम से कंप्यूटर को खिलाए जाते हैं।सीएनसी प्रोग्रामिंग को कंप्यूटर की मेमोरी में रखा जाता है।कोड स्वयं प्रोग्रामर द्वारा लिखा और संपादित किया जाता है।इसलिए, सीएनसी सिस्टम कहीं अधिक विस्तृत कम्प्यूटेशनल क्षमता प्रदान करते हैं।सबसे अच्छी बात यह है कि सीएनसी सिस्टम किसी भी तरह से स्थिर नहीं हैं क्योंकि संशोधित कोड के माध्यम से नए संकेतों को पहले से मौजूद कार्यक्रमों में जोड़ा जा सकता है।